清乾隆三十八年(1773)，镇西府设教授衙门，清咸丰五年（1855）镇西厅设学政衙门。民国9年（1920），镇西县设教育局（后改称教育科）。1950年，镇西县设教育科。1967年，巴里坤县设文教卫生组。1973年，撤文教卫生组，设文教卫生局。1981年,文教、卫生分设，成立工农教育办公室。1998年，县教育局改称县教育委员会（以下简称县教委）。2002年，县教委又改称县教育局。2017年，成立巴里坤哈萨克自治县教育工委，为县委派出机构，与县教育局合署办公，教育工委所需人员编制在县教育局内部协调解决。

政府信息公开机构名称：新疆巴里坤哈萨克自治县教育局

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