巴里坤县住建局内设办公室、建管科、建设科、住房保障科、市政公用科、村镇科、消防科7个职能科室。

办公室：负责文电、会务、档案等工作，承担信息、政务、绩效考核、目标管理、综合治理、议案建议提案办理工作；负责重要文件、文稿的起草及重点工作的调研工作；负责受理、转办、交办群众来信来访等工作。
    住房保障科：编制县住房保障发展规划和年度计划并监督实施；指导县保障性安居工程工作；指导城镇房屋征收拆迁、土地使用权有偿转让和开发利用工作等工作。

建管科：负责拟订规范辖区内建筑市场各方主体行为、房屋建筑、工业园区与矿山的房屋建筑工程项目招投标、工程监理、合同备案、工程风险管理、建筑安全生产、建筑工程质量等管理制度并监督执行；负责建筑业和勘察设计咨询业统计工作；负责工程造价管理等工作。

建设科：负责拟订城市（县城）建设和市政公用事业发展战略、中长期规划、改革措施、行业政策，并指导实施；负责贯彻执行国家、自治区有关城市环境卫生管理、市容环境综合整治法律、法规规章和规范性文件；拟订实施城市环境卫生事业、市容环境综合整治、公共厕所建设管理发展规划和年度计划等工作。

村镇科：指导村镇基础设施建设和农村住房建设、农村住房安全、危房改造和游牧民定居工程建设；指导村镇基础设施建设和农村住房建设；组织村镇建设试点，指导国家级自治区重点镇建设；指导小城镇和村庄人居生态环境改善和村容村貌治理等工作。

消防科：拟订全市建设工程消防设计审查、消防验收、备案和抽查相关政策、制度以及具体管理办法。监督指导建设工程参建各方落实消防质量责任。配合有关部门做好火灾事故调查工作。配合做好“联合审查”、“联合验收”工作。负责职责范围内建设工程消防设计审查、消防验收、备案和抽查工作。依法对特殊建筑工程未经消防设计审查或者审查不合格的建筑、施工单位实施行政管理和行政处罚工作。